日本では数少ない24時間運用が可能な空港の1つである。深夜から未明の時間帯にかけては国際線チャーター便や貨物便が発着するのみとなっている。国内線の各旅客ターミナルビルの開館時間は、定期便の運航時間帯に合わせ、第1旅客ターミナル・第2旅客ターミナルとも5:00-24:00ごろとなっている。

2010年10月21日に国際線ターミナルが開業し、10月31日からは、これまで国際線定期チャーター便として運航されている便は定期便に格上げされた。

空港の設置及び空港機能の管理・運用は国土交通省東京航空局東京空港事務所が行い、各ターミナルビルの管理・運用は日本空港ビルデング株式会社が行っている。なお、2010年10月に開業した国際線ターミナルビルについては東京国際空港ターミナル（TIAT=ティアット=）株式会社によって建設され、空港としては初のPFI事業として、国との間で締結した事業契約のもとTIATが運営する。

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